Ekosystemy wodne czyli wszystkie zbiorniki wodne znajdujące się na świecie to drugie po powietrzu źródło życia wszystkich organizmów żywych. Ich zanieczyszczenie, tym samym doprowadza do chorób i wymierania poszczególnych gatunków roślin i zwierząt. Zagadnienie związane z zanieczyszczeniem wód jednakowo dotyczy wód śródlądowych jak i mórz i oceanów. Najpierw zostają skażone morza i oceany, potem natomiast nasze pobliskie rzeki, strumienie, jeziora oraz zbiorniki wodne utworzone przez człowieka.
Substancje szkodliwe i toksyczne które najczęściej zanieczyszczają nasze wody pochodzą między innymi z nawożonych chemicznie gleb, ze środków stosowanych w rolnictwie przeciwko owadom, chwastom, roztoczom oraz szkodliwym grzybom, które mieszczą w sobie ogromne ilości składników chemicznych takich jak fosforany i azotany, niszczących naturalne środowisko przyrodnicze. Wody są również zanieczyszczane poprzez produkty wykorzystywane na fermach hodowlanych (antybiotyki i hormony podawane zwierzętom), które w następstwie przedostają się do gleb oraz przyległych wód.
Kolejnym poważnym zanieczyszczeniem wód nadziemnych i podziemnych jest stale rozwijający się przemysł. Związki szkodliwe to między innymi metale ciężkie takie jak: kadm, cynk i ołów oraz kwaśne deszcze spowodowane unoszącymi się do atmosfery spalinami tworzącymi się podczas spalania paliw wykopaliskowych czyli ropy naftowej i węgla kamiennego.
W zakładach trudniących się sprawdzaniem jakości wody oraz ilości szkodliwych związków zawartych w zbiornikach wodnych, również dochodzi do zanieczyszczeń. Niestety proces chlorowania wody wywołuje związki rakotwórcze, a siarczan glinu stosowany do oczyszczania wody działa niesprzyjająco na ekosystem naturalny. Badanie jakości wody oraz jej uzdatnianie do spożycia jest niezbędne w obecnych czasach, jednak jak się okazuje nie do końca pozostaje bezpieczne dla naszego środowiska.
Wszelkiego rodzaju środki trujące przedostające się do wody to niestety wynik gospodarczej działalności człowieka na ziemi. Czy jest to zanieczyszczenie bezpośrednie czy pośrednie, tak samo ma niekorzystny wpływ na jakość wody w naszym otoczeniu i doprowadza do jej poważnych zanieczyszczeń. Największym zagrożeniem dla czystości naszych wód jest rolnictwo, które rozwijając się w szybkim tempie dostarcza środowisku dodatkowych związków trujących. Każdy rolnik stosuje w swoim gospodarstwie do poprawienia jakości gleby nawozy azotowe, potasowe i fosforowe, które w następstwie stają się plagą nieszczęść dla życia organizmów wodnych i lądowych środowiska naturalnego.
Również wycinanie lasów na szeroką skalę oraz budowa wykopów melioracyjnych jest niebezpiecznym procesem powodującym przedostawanie się do wody związków chemicznych takich jak kadm, żelazo i glin, a tym samym burzących naturalny rozwój środowiska. Pozostałe starzejące się lasy zakwaszają glebę, a młode jeszcze nie wyrośnięte drzewka nie mają odpowiednich związków chroniących glebę przed zatruciem. Lasy pochłaniają ogromne ilości dwutlenku węgla i wytwarzają mnóstwo czystego tlenu, a ich nadmierne wycinanie powoduje osadzanie się związków toksycznych takich jak popiół, sadza, dwutlenek siarki i podtlenek azotu w glebie oraz spływanie wraz z deszczem do pobliskich wód, gdzie tworzą trujące kwasy: azotowy i siarkowy.
Zanieczyszczenia wodne rozprzestrzeniają się w bardzo szybkim tempie, skażając cały zbiornik wodny. Chemikalia zanieczyszczające występują zarówno w stanie ciekłym jak i stałym i przedostają się do wody bezpośrednio poprzez wrzucenie odpadów oraz pośrednio poprzez pozostawienie substancji na ziemi i spłynięcie ich do wody wraz z deszczem. Niestety obecnie substancje trujące jako nawozy i inne środki chemiczne są produkowane na skalę światową, a wyeliminowanie ich z rynku jest niemożliwe, jednak musimy pamiętać że czystość powietrza i ekosystemów wodnych to podstawa do zachowania życia roślinności, zwierząt i nas samych na Ziemi.